autometa package

Subpackages

• autometa.binning package
  • Submodules
  • autometa.binning.recursive_dbscan module
  • autometa.binning.summary module
  • autometa.binning.unclustered_recruitment module
  • Module contents
• autometa.common package
  • Subpackages
    • autometa.common.external package
      • Submodules
      • autometa.common.external.bedtools module
      • autometa.common.external.bowtie module
      • autometa.common.external.diamond module
      • autometa.common.external.hmmer module
      • autometa.common.external.prodigal module
      • autometa.common.external.samtools module
      • Module contents
  • Submodules
  • autometa.common.coverage module
  • autometa.common.exceptions module
  • autometa.common.kmers module
  • autometa.common.markers module
  • autometa.common.metagenome module
  • autometa.common.utilities module
  • Module contents
• autometa.config package
  • Submodules
  • autometa.config.databases module
  • autometa.config.environ module
  • autometa.config.utilities module
  • Module contents
• autometa.datasets package
  • Module contents
• autometa.taxonomy package
  • Submodules
  • autometa.taxonomy.lca module
  • autometa.taxonomy.majority_vote module
  • autometa.taxonomy.ncbi module
  • autometa.taxonomy.vote module
  • Module contents

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